El juego tiene lugar en un transcurso de tres días durante el año 2013, comenzando en la Ciudad de México. Un avión espía de EE.UU. transporta al Guardrail IX, un dispositivo capaz de interrumpir las comunicaciones inalámbricas, el cual es derribado en Nicaragua. Inteligencia descubre un complot para transferir el dispositivo a rebeldes en la ciudad de México y los Ghosts son enviados para recuperarla. Uno de los rebeldes se identifica como el coronel Carlos Ontiveros, hijo del mexicano Gen Ontiveros quien era un estudiante de Bud, amigo de Mitchell y un piloto de UH-60s. La misión se interrumpe cuando un golpe de estado comienza en la Ciudad de México y los Ghosts son enviados de inmediato a la capital mexicana, donde una cumbre de la participación de los 3 dirigentes, el presidente de EE.UU.